主角工(gōng )藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探,在目击黑暗组(zǔ )织的地下交易后,正准备(bèi )追踪时(shí )却被突袭击昏,并被(⏬)灌下代号为“APTX4869”的不明药aaa。后来虽然幸免于死,但身(shēn )体就此缩小为小学时(✖)期的模(🚸)样(🖍)。之后他化名为江户川柯南,在邻居(jū )阿笠博士的(🚨)建议下,寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家(🤠)中,继续秘(mì )密从事追查黑暗组织(zhī )的工(🤷)作,并私下探寻获得解药的管道,希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时(🏉),柯南凭着自己的推理天份,配合阿笠博士为他发明的道具,帮(bāng )助毛利小五郎(🎥)成为出名的大侦探。故事内(💏)容当中穿插(chā )许多爱情、(🏃)友情、犯罪、背叛、复(🐖)仇等情节。