主角工藤新一原本是一位(wèi )颇具名声的高中生侦探,在(🕸)目击黑暗(🤢)组织的地下交易后,正准备追踪时却被突袭(😧)击昏,并被灌(guàn )下代号为“APTX4869”的不明(míng )药(🛍)aaa。后来虽然幸免(miǎn )于死,但身体(🛺)就此缩小为小学时(✖)期的(de )模样。之后他化名为江户川柯南,在邻居阿笠博(bó )士的(de )建议下,寄住在女友毛利兰(lán )(㊗)的父亲—侦探毛利小五郎家中,继续秘密从事追查黑暗组(🍄)织的(🥫)工作,并私下探寻获得解药的管道,希望(wàng )能够恢复原(yuán )来新一(yī )的样貌。与此同时,柯南凭着自己的推理天份,配合阿笠博士为他发(💅)明的道具,帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内(nèi )容当中穿插许多爱情、友(🔞)情、犯罪、背叛、复(🐖)仇等情节。